Naast de controle-actoren opgenomen in de "afsprakennota single audit" zijn ook andere publieke instanties bevoegd voor controle en/of toezicht actief binnen de lokale besturen in Vlaanderen. Audit Vlaanderen zal ook in deze werkzaamheden steeds streven naar het hanteren van het single audit-principe. Dit houdt onder meer in dat er in functie van de bevoegdheden en taakstelling van elke publieke controle- of toezichtsinstantie informatie, waaronder het auditrapport, kan uitgewisseld worden tussen Audit Vlaanderen en deze instantie. Dergelijke informatie-uitwisseling zal steeds onderdeel zijn van een samenwerkingsovereenkomst.
Dit principe gaat bij uitstek op voor de samenwerking met het Agentschap Binnenlands Bestuur, waarmee Audit Vlaanderen een samenwerkingsovereenkomst afsloot.
Op 10 mei 2017 werd de globale afsprakennota single audit in de Vlaamse administratie en de lokale besturen ondertekend. De nota bevat afspraken tussen de Inspectie van Financiën, het departement Financiën en Begroting, het Rekenhof, het Instituut van de Bedrijfsrevisoren, Audit Vlaanderen en de Vlaamse Auditautoriteit Europese Structuurfondsen.
Met de afsprakennota beogen de controleactoren dubbel werk te vermijden, de controlelast voor de geauditeerde entiteiten van de Vlaamse administratie, de lokale besturen en de begunstigden van de Europese structuurfondsen te verminderen en de kostenefficiëntie van hun audits te verhogen. lnformatiedeling tussen de verschillende partijen is hierbij de belangrijkste kerngedachte.
Een aantal lokale besturen beschikken over een eigen interne auditdienst. In 2023 was er wederom op verschillende momenten informeel contact met deze interne auditdiensten. Ook in 2023 faciliteerde Audit Vlaanderen een externe evaluatie van de werking van de interne auditdienst van de provincie Antwerpen en van Audio.